过滤气室也叫滤波气室，因为红外线气体分析仪如不设置过滤气室就无法克服背景气体对被分析气体中待测组分的干扰。如在合成氨生产中，要分析CO的含量，其背景气中含有N2、H2、CO2等组分，N2和H2是同一原子组成的双原子气体，它们不吸收1-25μm波长的红外线辐射能，但CO和CO2的特征吸收波长的范围有重叠，这就很明显地会引起CO2对CO测量的干扰。

为了避免干扰组分的存在给测量带来误差，在分析有干扰组分存在的混合气体的某一组分时，就设置过滤气室，过滤气室中充满了与待测组分浓度相同的气体与中性气体的混合气体（干扰作用的气体）。这样，当脉冲红外线光谱通过过滤器气室时，干扰组分就会按照自身的特征吸收波长，把这一范围的红外线全部吸收掉。这时，进入接收器气室两侧的红外线辐射能量的差值，仅是经过过滤器气室，参比气室后没有被吸收的红外线与通过测量气室后被分析组份吸收后的红外线他们之间的差值了，这个差值的大小与待测组分的浓度成正比。